经济补偿金单位缴纳五险一金的处理，存在以下特殊情况或例外情形。
1. 单位因经营困难申请缓缴社保：根据《社会保险法》第六十二条，单位因不可抗力等法定事由可申请缓缴，但需经社保经办机构批准，且缓缴期间不影响劳动者待遇。若单位未获批擅自缓缴，仍属违法。
2. 劳动者已在其他单位缴纳社保：若劳动者同时与多家单位建立劳动关系，且已有一家单位缴纳社保，其他单位仍需为其缴纳工伤保险（部分地区规定），但住房公积金需按规定缴纳，否则仍属违法。
3. 单位与劳动者协商补缴但未履行：若双方达成补缴协议，单位未按协议履行，劳动者可依据协议申请仲裁或诉讼，要求单位履行义务。
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单位未依法缴纳五险一金可能导致以下法律风险。
1. 诉讼时效风险：例如，劳动者在离职1年后才发现单位未缴社保，此时申请仲裁可能因超过时效被驳回，无法获得补缴或赔偿。
2. 经济损失风险：例如，劳动者因单位未缴医疗保险，生病住院时无法报销医疗费用，导致个人承担高额支出；或因未缴住房公积金，无法申请公积金贷款购房，增加购房成本。
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关于经济补偿金单位缴纳五险一金的合法性，可依据《社会保险法》等法律法规分析。
根据《中华人民共和国社会保险法》第五十八条：“用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记……” 第六十条：“用人单位应当自行申报、按时足额缴纳社会保险费，非因不可抗力等法定事由不得缓缴、减免。职工应当缴纳的社会保险费由用人单位代扣代缴……” 住房公积金管理条例》第十五条：“单位录用职工的，应当自录用之日起30日内向住房公积金管理中心办理缴存登记……” 经济补偿金是用人单位因解除或终止劳动合同支付的补偿，与社保缴纳分属不同法律关系。单位缴纳五险一金是法定义务，若从经济补偿金中扣除单位应缴部分，或未缴全险种，均违反上述规定，结论为不合法。
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经济补偿金单位缴纳五险一金的合法性需结合具体情况判断。
经济补偿金单位缴纳五险一金不合法。

1. 若用人单位在支付经济补偿金时，要求从补偿金中扣除本应由单位承担的五险一金部分：违反法律规定，经济补偿金是对劳动者的补偿，单位应缴的社保费用属法定义务，不得转嫁。
2. 若用人单位仅为劳动者缴纳部分险种（如三险一金）而非全部五险一金：不符合《社会保险法》规定，单位需依法补缴缺失险种。
3. 若双方协商一致由劳动者自愿放弃部分社保：即使协商一致，仍因违反法律强制性规定而无效，单位需按法定标准缴纳。

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